PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍-自主发布-资讯-生物在线

PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍

作者:天津生物芯片技术有限责任公司 2015-01-26T15:01 (访问量:5881)

2015年,PacBio公司计划将其测序通量提高4倍,提高测序reads长度,增加样品制备操作手册及多个数据分析的应用程序。总结起来就是更高(通量)、更长(读长)、更快(分析)。

PacBio首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,公司计划提高PacBio RS II测序平台的通量,使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,平均读取长度增加到15-20KB

2014年秋天PacBio升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,平均读长达到10-15KB。最初的PacBio RS II平台,一天运行16SMRT Cell只能产生6.4G的原始数据。

天津生物芯片公司为满足广大合作伙伴将测序试剂盒升级到P6C4平均N50读长增加到10-14K这将进一步提升小基因组测序的成功率,(国内目前常用的测序试剂盒为P4C2的三代测序试剂盒,平均读长在4-5K)。

PacBio公司计划通过提升化学试剂,操作流程及软件来提高测序质量。包括将单一聚合酶加载到芯片上,从而提高装载效率。

在数据分析方面,PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的de novo组装基因组的算法,进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的分析工作,简化全长转录本测序、Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。

天津生物芯片利用第三代测序平台,能为合作伙伴提供优质的基因组组装、碱基修饰检测、全长转录组测序、目标区域测序等技术服务。

Pacbio工作流程

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