如何利用定量蛋白质组学研究样本在不同条件下的酰基化差异?
产品名称: 如何利用定量蛋白质组学研究样本在不同条件下的酰基化差异?
英文名称: How to Use Quantitative Proteomics to Compare Acylation Across Conditions?
产品编号: acylation-proteomics-zh10
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产品产地: 中国北京
品牌商标: 百泰派克生物科技
更新时间: 2026-01-01T11:14:49
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在后基因组时代,翻译后修饰(PTMs)逐渐成为揭示蛋白质功能多样性与调控机制的研究热点。酰基化(Acylation),尤其是乙酰化、丙酰化、丁酰化、马来酰化等多种形式,作为一类重要的赖氨酸修饰方式,广泛参与调控代谢、信号转导、染色质重构等关键生物过程。然而,这些修饰常常以低丰度、可逆性强、动态变化快为特征,给常规检测方法带来了挑战。定量蛋白质组学技术,尤其是结合免疫富集、液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)和稳定同位素标记策略,已成为研究不同条件下酰基化修饰变化的核心工具。
一、什么是酰基化?为何值得关注?
酰基化是指将不同类型的酰基基团(如乙酰、丙酰、丁酰等)共价连接到蛋白质赖氨酸残基上。以乙酰化为例,它不仅调控组蛋白的染色质结构变化,还广泛存在于代谢酶、转录因子、信号蛋白中:
- 调控蛋白活性:例如,乙酰化可抑制某些代谢酶的催化功能;
- 影响蛋白定位:酰基化可能决定蛋白是留在细胞核,还是转移至线粒体;
- 参与疾病机制:肿瘤、代谢综合征、神经退行性疾病等中常观察到异常酰基化图谱。
在不同的生理或病理条件下,酰基化的位点与程度可能发生显著变化。要精准捕捉这种差异,定量蛋白质组学技术无疑是最有效的手段。
二、如何开展酰基化差异的定量蛋白组学研究?
要系统研究不同处理条件(如药物刺激、缺氧、高糖、敲除模型等)下酰基化的变化,可采用以下经典技术路线:
1、样本准备与处理
(1)提取总蛋白,进行酶切(通常为胰蛋白酶);
(2)使用特异性抗体富集酰基化肽段,如抗-乙酰赖氨酸抗体;
(3)采用SILAC、TMT/iTRAQ等稳定同位素标记技术,实现不同样本间的定量蛋白质组学对比;
(4)在复杂样本中也可选用无标记定量(Label-Free Quantification),适用于临床样本或难以标记的系统。
2、高分辨率LC-MS/MS检测
利用高分辨率Orbitrap或TOF质谱平台对富集后的酰基化肽段进行深入扫描分析。参数优化包括:
(1)使用HCD或ETD裂解模式,保留修饰信息;
(2)增加动态排除时间以提高低丰度肽段的检测机会;
(3)多级MS/MS(MS3)策略提升定量蛋白质组学分析的准确性。
3、数据分析与生物信息学挖掘
(1)利用如MaxQuant、Proteome Discoverer、Spectronaut等软件进行修饰位点鉴定;
(2)对比不同条件下的酰基化水平变化,筛选差异位点;
(3)富集分析通路(GO/KEGG)和蛋白互作网络(PPI)揭示其潜在生物学功能。
三、挑战与策略:提升酰基化定量的灵敏度与准确性
尽管目前蛋白组学技术已高度成熟,但酰基化修饰的定量仍面临如下挑战:
- 修饰丰度低,难以被检测到;
- 富集效率受抗体质量影响大;
- 异构修饰(如乙酰与丙酰)可能干扰位点判读。
应对策略包括:
- 严格优化富集流程,采用多轮免疫纯化;
- 搭配多种酰基化抗体进行平行检测;
- 引入DIA(数据独立采集)技术,提高覆盖率与定量蛋白质组学分析的重复性。
四、百泰派克生物科技:为您的酰基化蛋白组学研究保驾护航
在百泰派克生物科技,我们深知翻译后修饰研究对生命科学研究的重要性。我们提供:
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- 完整的数据分析报告,助力客户快速获得高价值科研发现。
我们已为多个科研机构和生物医药企业提供定制化蛋白修饰组学解决方案,广泛应用于代谢、免疫、肿瘤等研究领域。
酰基化作为一种关键的蛋白质翻译后修饰,在生命活动中发挥着深远的调控作用。利用先进的定量蛋白质组学方法,不仅可以系统描绘其在不同条件下的动态变化,还能为疾病机制研究、药物开发提供重要线索。如果您正在探索蛋白修饰领域的前沿问题,或面临酰基化研究中的技术难题,欢迎联系百泰派克生物科技,我们将以专业、高效、精准的科研服务助力您的创新研究。
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百泰派克生物科技特色项目
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百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
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6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
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三、单细胞质谱流式技术分析
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百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
五、生物药物表征
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
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